生物燃料的优点：
1.改善生态环境。我区使用的生物质燃料主要是指稻壳等农业残余物和锯末等木材加工残余物，由于随意堆弃，利用水平低，产生扬尘且污染环境。我区把废弃生物质作为燃料，有利于杜绝其随意堆弃的现象，使废弃生物质变废为宝，减少了资源的浪费，改善了环境污染，为解决农业残余物和木材加工残余物找到了较好的出路。
2.增加经济效益。全区可替代燃煤约2万吨，这可大大缓解煤炭供应紧张、企业燃煤成本增加的严重问题。
3.推进节能减排。生物质燃料产生的锅炉废气污染物很少，蒸吨数低的锅炉可以做到不配套废气治理设施就能达标排放，我区已进行试点推广的9家企业，共可减少二氧化硫排放320吨、烟尘排放160吨。生物质能二氧化硫排放不到煤的十分之一，由于生物质在燃烧过程中排放出的二氧化碳与其生长过程中光和作用中所吸收的一样多，所以从循环利用的角度看生物质燃烧对空气二氧化碳的净排放为零;同时由于燃烧生物质减少了秸秆等自然腐烂所产生的甲烷，进一步减少了温室气体的排放(通常认为甲烷气体的温室效应是二氧化碳的21倍);在减碳成本上，将生物质能作为锅炉燃料燃烧也是最符合经济规律的，它是目前最经济可行的减排二氧化碳手段之一
生物燃料的缺点: 中科院农业政策研究中心副研究员仇焕广表示，现在关于生物燃料确实有很多争议。对于美国来说，农民很支持发展生物燃料，因为这样可以提高粮食价格。同时，很多农民都可以就地办企业。这些企业还享有政府的补贴，农民的积极性很高。 但生物燃料的发展肯定会让贫穷国家的粮食问题更加严重。发展生物燃料势必会让粮食价格继续攀升。也就是说，富人的“环保”正在使穷人更饥饿。
另外一个问题是生物燃料的能量效率并不太高。在美国，主要用玉米生产生物酒精。在这个过程中，需要经过播种、浇水、施肥、除草、收割、籽实脱水、发酵、蒸馏、运输等过程都要消耗能源，最终获得的酒精燃烧所释放的能量并不比生产它所消耗的能量大多少。有一个比率叫“化石燃料比率”，它指的是生产某种燃料时，耗费的“标准化石燃料能量”和这种燃料能够产生的能量的比率。汽油的这个比率是0.81，也就是说生产汽油所消耗的“标准化石燃料能量”比它燃烧产生的能量要少。而玉米酒精的“化石燃料比率”高达1.36，就是说它的效率还不如化石燃料的标准值，比汽油差得远，而纤维素酒精的这个比值就很难看，高达10.3。
在前几年油价高，空气污染问题被提得很多的时候，我国曾经比较积极地发展生物燃料，但现在油价回落，并且考虑到我国的粮食安全问题，我国政府已经规定未来生物燃料生产的发展必须依赖非粮原料，保证生物燃料的发展“不与人争粮，不与粮争地、不与畜争料、不与农争利”。
生物燃料的缺点的对策
1.加强宣传力度。发展生物质燃料具有良好的经济、社会及环境效益。生物质燃料的推广和应用，不仅可以保护环境，缓和气候变化，还能促进农业产业链条的延长。由于我国劳动力成本相对低，发展生物质能源比发达国家更具竞争力，生物质能源的有效利用，是一项“功在当代，利在子孙”的能源利用技术，应该在做好示范工程的基础上，加大宣传力度，使生物质能源逐渐走入人们的生活。
2.制定管理办法和技术规范。制定生物质燃料管理办法和技术规范，为生物质燃料及锅炉制定严格的技术标准，加强技术监督和市场管理，为生物质燃料的推广创造良好的市场环境。使用生物质燃料的单位，要制定相关规章制度，强化锅炉运行管理，司炉工须经培训持证上岗，严格按照规程操作；生物质燃料燃烧后产生的灰渣系农业肥料和工业原料，确保使用单位不随意抛洒、堆放和丢弃，以免造成扬尘污染和资源浪费；灰渣应袋装保存，由燃料供应商统一回收，进行综合利用。
3.落实相应的扶持政策。在摸底调查的基础上，根据实际情况，结合在生物质颗粒燃料推广过程中出现的新问题，制定相应的扶持政策，并建立相关档案以便核查节能减排效果，给予企业相应的补助，确保推广工作规范、健康地开展。
