日前，南通市人民政府办公室印发《南通市“十四五” 生态环境基础设施建设规划》,据测算，到“十四五”末期，南通市主城区暂不存在城镇生活污水处理能力缺口，而其余县（市、区）出现不同程度的缺口，其中通州区的缺口最大，约 7.80 万吨/日。从市级综合来看，南通市到“十四五”末期的城镇生活污水处理能力缺口量约 32.19 万吨/日。到“十四五”末期全市工业污水处理能力缺口约为 22.52 万吨/日。
城乡污水处理设施建设目标：到 2025 年，各县（市、区） 城市建成区 60%以上面积建成“污水处理提质增效达标区”，基本实现污水管网全覆盖、全收集、全输送、全处理，实现“污水不入河、外水不进管、进厂高浓度、减排高效能”，全面构建“源头管控到位、厂网衔接配套、管网养护精细、污水处理优质、污泥处置安全”的城镇污水收集处理新格局。全市农村生活污水治理率达 80%，自然村生活污水治理率大幅提高，农村生活污水治理农户覆盖率明显提升。
工业废水处理目标：省级及以上工业园区和主要涉水行业所在园区污水管网全覆盖、工业废水集中处理设施稳定达标运行。 在电镀、印染等园区基本实现“一企一管”全覆盖，完善相应监测监控设施。进一步完善园区污水处理厂管理平台，对全市所有工业园区污水处理厂进行全过程、智慧化监管并实现联网。