鉴于我国农村畜牧业的发展，牲畜粪便日益增多，为方便进、出料和充分利用畜便资源，目前提倡纯粪便作为沼气发酵原料。
1.碳氮比 正常的沼气发酵要求一定的原料碳氮比。 因此，在原料配比中， 除了考虑上述产气特性外，还应考虑有适当的碳氮比。
实践证明，原料的碳氮比过高（30/1以上），发酵就不易启动，而且影响产气效果。农村沼气发酵原料的碳氮比以多少为适宜，目前看法不一。有些学者认为在沼气发酵中，原料的碳氮比要求不很严格。根据我国农村发酵原料是以农作物秸秆的人、畜粪便为主的情况，在实际应用中，原料的碳氮比以20-30：1搭配较为适宜。
碳氮比较高的发酵原料如农作物秸秆，需要同含氮量较高的原料，如人畜粪便配合以降低原料的碳氮比，取得较佳的产气效果，特别是在第一次投料时，可以加快启动速度。在使用作物秸秆为主要发酵原料时，如果人畜粪便的数量不够，可添加适量的碳酸氢铵等氮肥，以补充氮素。
2.浓度 在沼气发酵中保持适宜的发酵料液浓度，对于提高产气量，维持产气高峰是十分重要的。发酵料液浓度是指原料的总固体（或干物质）重量占发酵料液重量的百分比。
国内外研究资料表明：能够进行沼气发酵的发酵料液浓度范围是很宽的，以1%-30%，甚至更高的浓度都可以生产沼气。在我国农村，根据原料的来源和数量，沼气发酵通常采用具%-10%的发酵料液浓度是较适宜的。在这个范围内，夏季由于气温高，原料分解快，发酵料液浓度可适当低一些，一般以6%左右为好；在冬季，由于原料分解较慢，应适当提高发酵料液浓度，通常以10%为佳。同时，对于不同地区来讲，所采用适宜料液浓度也有差异，一般来说，北方地区适当高些，南方地区可以低些。总之，确定一个地区适宜的发酵料液浓度，要在保证正常沼气发酵的前提下，根据当地的不同季节的气温，原料的数量和种类来决定。合理的搭配原料，才能达到均衡产气的目的。从经济的观点分析，适宜的发酵料液浓度不但应获得较高的产气量，而且应有较高的原料利用率。
3．粪草比 人畜便和秸秆是我国农村最主要的发酵原料，也是产气性质有较大区别的两类原料。由于我国农村现在普遍采用秸秆和粪混合的发酵原料，根据所要用的原料确定适宜的烘草比例是很重要的。实践证明，既使原料相等由于粪和草的比例不同，发酵产气效果差异是很大的。所谓粪草比，是指投入的发酵原料中，粪草的重量与秸秆类重量之比。
试验表明，采用半连续发酵或批量发酵工艺，在沼气池第一次投料启动时，混合原料中的粪草比是影响产气效果的一个重要因素。考虑到农村目前的实际情况，在生产应用中，粪草比一般应达到2：1以上，不宜小于1：1。如果粪草比小于1，为了加快启动速度，提高产气量，需要采取措施，如可添加适量的氮素化肥。
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