补贴拖延核心问题还在于资金缺口。从可再生能源发展基金诞生之日，资金缺口问题就一直存在，特别是可再生能源电价附加资金早已入不敷出。据电监会刚刚发布的《节能减排电价政策执行情况监管通报》，截至2011年底，可再生能源电价附加资金缺口达110亿元。
虽然大家都在讲补贴资金有很大的缺口，接受采访的一些业内人士表示，并不清楚每年电价附加收入资金总额到底是多少。对此，有关主管部门并没有进行定期结算和公示。伴随着可再生能源装机的不断增加，在过去的几年间，可再生能源电价附加的缺口成倍增加。由于历史欠债，2012年电价附加收入有一部分需要弥补此前的资金缺口，业界更有了“寅吃卯粮”的说法。
巧妇难为无米之炊。不论是由谁管理资金，资金收入端的问题必然传递到支出端。《暂行办法》规定，可再生能源电价附加在除西藏自治区以外的全国范围内，对各省、自治区、直辖市扣除农业生产用电(含农业排灌用电)后的销售电量征收。实际上，根据以往电网公司征收经验，电价附加收入应该是在全社会用电量×8厘的基础上打个8折。
造成此结果的原因除了西藏和农业生产用电排除在外，虽然国家规定要对企业自备电厂自发自用电量进行附加征收，可是由于其电量和管理不通过电网企业，很难对其用电量进行测算。对此，除了自备电厂不好测算，同时地方执行动力不足，有可能收上来那么多电价附加，在本地用不完还要分给别的省份。前端收入打了折扣，而随着可再生能源快速发展，补贴需求不断增加，可再生能源基金面临更大压力。
在我国，可再生能源电价附加收入主要是用于风电、太阳能、生物质地面电站项目，太阳能项目中光伏建筑一体化以及金太阳项目补贴资金是由国家财政年度安排的专项资金支付。2012年全年预计用电4.5万亿度，按照8厘/千瓦时征收标准，可收可再生能源附加约为300亿元。2012年，风电发电量大约为1000亿度，需补贴部分约为200亿元；光伏上网电价项目估计发电30亿度，需补贴20亿元；生物质发电补贴需要补贴80亿元，总计约300亿元。
这也就意味着，2012年应收可再生能源附加收入刚好够2012年可再生能源发电补贴需要。值得注意的是，此前的欠款以及2013年中国风电和光伏发电将持续增长，特别是光伏发电进入高速增长期，将给资金带来更大的压力。“国家计划于2013年底前支付2011年及以前的补贴。而2013年补贴需要预计是450亿元。
去年9月，国家能源局发布《太阳能发电发展“十二五”规划》，指出到2015年底，太阳能发电装机容量达到2100万千瓦以上。此前，对于“十二五”太阳能装机目标，已经进行了4次修改，从最初的500万千瓦到1000万千瓦，去年5月上调至1500万千瓦一直到9月份的2100万千瓦。
然而，就在规划出台的短短几个月内，对于再次上调“十二五”太阳能发展目标的消息一直不绝于耳。“2012年，金太阳项目总量大致是450万千瓦。为鼓励分布式发展，国家能源局发布《关于申报分布式光伏发电规模化应用示范区的通知》，每个省可以建设总装机容量不超过500兆瓦分布式发电示范园区，全国上线1500万千瓦左右。此外，地面电站项目总量能达到1000万千瓦。因而，事实上，政府审批项目已经达到3000万千瓦。
