B．有的物质的分子比有的物质的原子大，有的物质的原子比有的物质的分子大，所以分子和原子不能比较大小，故说法错误；
C．氢原子中没有中子，故说法错误；
D．电子的质量约为质子质量的11836，故原子的质量主要集中在原子核上，故说法正确．
故选D．
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