B、以天然气为燃料时，仍有热散失、仍需克服摩擦做额外功，其机械效率不能达到100%，故B正确；
C、其中一个气门打开，活塞向下运行，故为吸气冲程；故C错误；
D、使用天然气作燃料的目的是减少环境污染、并且成本低，故D错误．
故选B．
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