有机肥根据其来源和制作方法，可分为：
1。堆肥： 以各类桔秆、落叶、青草、动植物残体、人畜粪便为原料，与少量泥土混合堆积而成的一种有机肥料。
2。沤肥： 沤肥所用原料与堆肥基本相同，只是在淹水条件下进行发酵而成。
3。厩肥： 指猪、牛、马、羊、鸡、鸭等畜禽的粪尿与秸秆垫料堆沤制成的肥料。
4。沼气肥： 在密封的沼气池中，有机物腐解产生沼气后的副产物，包括沼气液和残渣。
5。绿肥： 利用栽培或野生的绿色植物体作肥料。如豆科的绿豆、蚕豆、草木樨、田菁、苜蓿、苕子等。非豆科绿肥有黑麦草、肥田萝卜、小葵子、满江红、水葫芦、水花生等。
作物秸秆： 农作物秸秆是重要的有机肥之一，作物秸秆含有作物所必需的营养元素有N、P、K、 Ca、s 等。在适宜条件下通过土壤微生物的作用，这些元素经过矿化再回到土壤中，为作物吸收利用。
6。饼肥： 菜籽饼、棉籽饼、豆饼、芝麻饼、蓖麻饼、茶籽饼等。
7。泥肥： 未经污染的河泥、塘泥、沟泥、港泥、湖泥等。
现在，随着科学技术的不断发展，通过有益菌群的人工纯培养技术，采用科学的提炼，可以生产出多种多样不同品种的生物有机肥，它能改善土质、减少环境污染、增肥增效等。生物有机肥将是未来农业生产用肥的主要发展趋势。
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