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【专家解说】：楼主说石油科学研究院应该是中石化的石油化工科学研究院吧，主要方向是下游炼化，就业以科研单位或者各地方石化公司，硕士留院机会不多，建议直接读完博士。
石油大学的硕士就业还是比较广的，从上游钻探，开发，储运到下游炼化都有涉及。
如果你是化学方向的本科，这个两个单位其实都差不多的，建议直接读完博士，硕士不上不下很尴尬。