自然科学基金委与14个西欧、南欧和北欧国家的23个科学基金组织或研究委员会签定了科技合作协议或谅解备忘录，为双方科学家就共同感兴趣的科学问题开展合作研究提供了经费保障。我们将在平等互利、优势互补、强强联合、共同投入、风险共担、成果共享的原则基础上，重点加强在信息科学、生命科学、纳米科技、农业、材料科学、人类健康、环境等领域的合作；继续重点支持实质性的合作研究和双边研讨会项目；重点支持承担国家自然科学基金的中青年优秀科研人员、优秀研究群体和有一定合作基础的留学回国人员开展对欧合作；鼓励我国研究人员、研究群体和研究机构与欧洲的研究人员、研究群体和重点科研机构建立长期、稳定的关系，开展具有实质意义的合作与交流。?
英国：自然科学基金委与英国皇家学会（RS）共同资助由中英科学家开展的合作研究项目。双方每年年底共同商定下一年度的合作研究项目数，由中英双方科学家以一方为主，填写专用表格，向我委或英国皇家学会申请，我委受理申请的截止日期为每年11月15日。每个合作研究项目的持续时间为3年。详情见我委国际合作局网页。?
2003年，自然科学基金委将与英国工程和自然科学研究理事会（EPSRC）、英国生物技术和生物科学研究理事会（BBSRC）、英国粒子物理与天文学研究理事会（PPARC）合作，重点资助由中英两国科学家共同举办的小型双边研讨会。会议的中英双方主要组织者可分别向各自的资助机构提出申请，自然科学基金委与协议联络人共同负责落实双边研讨会的审批工作。同时，自然科学基金委与EPSRC、BBSRC和PPARC还鼓励中英两国科学家联合申请研究经费，具体做法是：中方科学家向自然科学基金委提出项目申请，英方科学家为项目主要参加人；英方科学家向EPSRC或BBSRC提出项目申请，中方科学家为项目主要参加人。?
德国：根据自然科学基金委与德意志研究联合会（DFG）签订的合作协议，双方每年的交流计划为100人月。协议所资助的合作类型包括短期访问（通常不超过三个月）、双边研讨会、合作研究项目。申请程序是：中德科学家向各自基金组织提出项目申请，由双方基金组织评审和协商后作出资助决定。2003年，将重点资助实质性合作研究项目、优秀青年学者间的交流、研究群体间的交流合作、跨学科合作研究。?
法国：自然科学基金委与法国国家科学研究中心（CNRS）、法国原子能委员会（CEA）、法国农业科学研究院（INRA）和法国海洋开发研究院（IFREMER）在基础研究和应用基础研究领域共同资助中法科学家的合作与交流项目。同时，在科技部指导下，自然科学基金委负责组织地球科学领域的专家对“中法先进研究计划”（PRA）地球科学领域的申请计划项目进行评审，并资助与科学基金项目相关的PRA项目。?
今后，自然科学基金委将继续支持中法政府间的合作项目（如PRA计划），有效利用协议渠道，鼓励广大科学家对法国开展实质性的合作研究，大力培养中法合作交流的学术带头人，同时注意知识产权保护，在“平等互利”的前提下提高合作的质量和效益。
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