1,全面规划，有序发展
我国目前的自然保护区生态旅游开发基本上是在自发状态下进行，难免出现盲目建设和重复建设的问题，对资金和资源都造成较大的浪费。因此，国务院有关自然保护区行政主管部门应加强部门之间的协调和合作，组织制定全国自然保护区生态旅游发展规划，并纳入全国旅游发展规划。可重点推出一批自然保护区生态旅游的精品路线或游览区，通过示范建设，推动全国自然保护区生态旅游的发展。
2,坚持以保护为主、旅游开发为辅的方针
自然保护区建设的首要任务是保护好区内的自然资源和自然环境，其他各项工作的开展都必须围绕保护工作而进行，尤其是保护区内的自然资源开发更不得以破坏资源和环境为代价。因此，生态旅游的开发必须已生态学原理为原则，以促进自然保护区生态环境的良性发展为目标。在保护好自然资源和自然环境的前提下根据自然保护区的总体规划适度开发。生态旅游开发区域必须严格限制在保护区实验区范围内，旅游接待能力和实际接待量不得大于保护区的旅游生态容量，真正达到保护和持续发展的双重目的。
3,加强生态旅游的宣传教育
针对目前生态旅游开发中普遍存在的重开发、轻宣传教育的问题，必须加大宣传教育的力度。一方面是通过利用保护区的展览馆、宣传牌以及导游讲解对游客进行直接的宣传教育；另一方面是通过电视、报刊等大众传媒工具进行范围更广泛的宣传教育，既起到对全民进行自然保护教育的作用，同时也起到扩大生态旅游社会影响、吸引更多的游客来自然保护区进行生态旅游的作用。
生态旅游的宣传教育对象还应包括自然保护区的管理人员。通过教育和培训，提高管理人员素质和管理水平，同时培养一批具备生态旅游管理知识的专门人才，以承担生态旅游开发所应开展的各项工作。
4,加强生态旅游的科学研究和生态监测
我国自然保护区生态旅游开发时间短、发展速度快，许多技术难题尚未得到较好的解决。自然保护区有关行政管理部门和自然保护区管理机构应组织科研力量、重点开展自然保护区生态旅游容量计算方法、资源开发利用阈值、生态旅游规划方法及生态旅游对保护区的潜在影响等研究，切实解决生态旅游发展中存在的问题。同时，开展生态旅
游的自然保护区还应加强生态旅游的生态监测工作，在旅游区建立永久监测点，并与核心区的研究样点同时观察，进行比较分析，以监测旅游开发区的环境质量变化，促进自然保护区生态旅游的健康发展。
5,严格控制规模，避免城市化
自然保护区的规划、建设必须与自然环境协调统一。禁止在保护区中集中建设大量的宾馆、饭店、商场、娱乐等设施，避免使用现在豪华的建筑、装饰材料，使人的主题横架于自然之上，使自然保护区的自然性受到严重的破坏。在任何实施阶段必须强化“自然保护”这一主题，正确处理保护与生态旅游开发的关系，促使其向着互相促进、协调的良性状态发展，避免过度开发利用，避免因经济利益的驱动而违背自然科学规律，避免以旅游为本而冲淡保护区的特色，要始终维护大自然的生物多样性。
6,科学解决能源问题
对大自然能源的消耗要用生态学的观点和方法解决，坚持“最小消耗”的原则，应
用先进的科学技术，建设“环保型”设施。严格控制旅游活动项目和经营项目，时刻注意能源利用和污染排放对环境与资源的损害，监测环境污染状况，监测旅游对生态系统的影响，监督协调旅游活动，科学的利用太阳能，水能，风能，开发沼气、液化气等替代能源。
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