生态系统保护的重点主要有以下5个方面：
第一，实施重要生态系统保护和修复重大工程，优化生态安全屏障体系，构建生态廊道和生物多样性保护网络，提升生态系统质量和稳定性。要坚持保护优先、自然恢复为主，充分发挥自然系统的自我调节和自我修复能力，通过封禁保护、自然修复的办法，让生态休养生息。
第二，完成生态保护红线、永久基本农田、城镇开发边界3条控制线划定工作。要调整优化空间结构，增加生态空间、城镇生活空间，减少工业空间、农产品生产空间、农村建设空间，通过空间规划的编制，全面划定城镇空间、农业空间、生态空间3类空间，划定生态保护红线、永久基本农田、城镇开发边界3条控制线，将开发强度管控和控制线落地上图。建立生态保护红线制度，全面完成全国生态保护红线划定、勘界定标，定期发布生态保护红线信息。
第三，开展国土绿化行动，推进荒漠化、石漠化、水土流失综合治理，强化湿地保护和恢复，加强地质灾害防治。要扎实推进荒山荒地造林，宜林则林、宜湿则湿，充分利用城市周边的工矿废弃地、闲置土地、荒山荒坡、污染土地以及其他不适宜耕作的土地等开展绿化造林。发挥国有林区林场在绿化国土中的带动作用。推进荒漠化、石漠化治理，推进沙化土地封禁保护区和防沙治沙综合示范区建设。综合治理水土流失，积极开展生态清洁小流域建设。
第四，完善天然林保护制度，扩大退耕还林还草。完善相关政策措施，落实好全面停止天然林商业性采伐。扩大退耕还林还草，严格落实禁牧休牧和草畜平衡制度，加大退牧还草力度，保护治理草原生态系统。加强林业重点工程建设，强化生态保护和修复，增加森林面积和蓄积量，精准提升森林质量和功能，加强森林保护。
第五，严格保护耕地，扩大轮作休耕试点，健全耕地草原森林河流湖泊休养生息制度。坚持最严格的耕地保护制度，坚守耕地保护红线。在重金属污染区、地下水漏斗区以及生态脆弱地区，扩大轮作休耕试点。
与此同时，要建立市场化、多元化生态补偿机制。完善各类自然资源有偿使用制度。推进资源税改革，扩大水资源税试点范围。全面推行碳排放权、水权市场交易，落实初始分配制度，创新有偿使用、预算管理、投融资机制。积极发展绿色信贷、绿色债券、绿色发展基金等绿色金融，设立市场化运作的各类绿色发展基金。探索环境治理项目与经营开发项目组合开发模式，健全社会资本投资环境治理回报机制。
来源：经济日报
