从上个世纪７０年代开始，沼气在我国农村风光了近２０年，随着第一批沼气池逐渐报废，我国农村利用沼气规模逐渐缩减。一些人士分析了相关原因：一是农民养殖结构改变，沼气原料来源减少。另一方面，农村没有固定地点处理废渣，而且农户每周一次清理费力费时。 要形成全社会重视并大规模利用沼气的良好态势，不能单靠一家一户的农民推广应用沼气，沼气利用必须走向市场，而且要走规模化经营道路，沼气发展须突破三大“瓶颈”：
首先是成本高，比较效益低。如南关沼气项目，投入成本达３０７万元，而工程的设计寿命只有１５年。据测算，按预计的年产沼气２５万立方米算，如果项目完全按市场规律运作，把成本、人员工资等都算在内，每方气卖５元都不挣钱。
其次是建厂条件高，需要配套的项目较多。原料要充足，沼气池最好建在规模较大的养殖场附近；排污要方便，沼气池最好建在果园、苗圃或蔬菜大棚附近；沼气出售则要求沼气池附近住户集中，否则管道的铺设又是一大笔费用。但是，这诸多条件很难统一，选址难成了一大问题。
再次是技术要求高。沼气池必须根据规模选用钢筋、混凝土等材料，尤其是反应罐和贮气柜，对抗压、防护要求更高；沼气湿气重，对脱硫设备、输气管道的腐蚀严重。目前这一难题仍难以克服，造成沼气工程寿命比较短。
