新能源发电的发展滞后问题。新能源发电项目发展相对滞后截至2009年12月底，江西省新能源装机总容量在华中区域六省市中排名第三，仅次于河南和湖北，但从2010年1月至2011年6月，江西新能源新增发电装机3.91万千瓦，占华中区域新能源新增装机容量的4%，仅超过四川省，远远低于其它四省市，发展速度相对滞后。
部分新能源发电项目建设与接入系统建设不同步由于新能源发电项目前期工作流程相对简单，核准进度快，建设周期相对较短，而电网接入系统在项目审查、方案确定及工程建设方面相对复杂，致使接入系统工程与新能源发电项目建设难以同步完成。同时电网公司很难及时掌握发电项目前期工作进展信息，使电网规划和建设有时处于非常被动的局面，电网建设难以适应。如中电投江西省新能源公司目前在建的4座风电场，接入系统比风场建设滞后三至四个月，其主要原因为部分风场在核准前已进行了大量前期工作，而自身建设周期较短，加之电网接入系统项目审批手续繁锁，审批时间长，致使电网企业难以确保送出工程与电源本体工程同步投产。
接网费用补贴规定有待完善国家对风电等新能源发电接入系统工程投资、运行维护等方面的相关规定尚未完善，部分接入系统工程补贴不足影响了电网企业投资建设的积极性。截至2011年6月，江西省电力公司为新能源接入系统已投资3895万元，而国家仅补贴525.8万元。风电项目一般远离负荷中心，其配套接入系统建设工程量大、投资高、线路长、线路利用率低，接入系统工程补贴政策的标准难以满足部分项目电网投资和运行维护的需要，影响了电力企业建设的积极性。
部分项目电费补贴不及时。部分新能源发电电费补贴大大滞后于电量上网时间，导致发电企业不能及时获得相应的电价补贴，影响企业的经营效益，部分规模较小的发电企业甚至出现流动资金周转困难的现象。江西金佳谷物股份公司自2010年9月16日～2011年10月15日已有900多万电费补贴没有及时到位，影响了企业正常的生产经营。
