B、在生态系统中只有绿色植物才能进行光合作用固定太阳能，消费者体内没有叶绿体，不能进行光合作用，必须依靠生产者储存在有机物中的能量才能生存，因此在生态系统中，流入该生态系统的总能量就是指绿色植物光合作用固定的能量，符合题意．
C、在生态农业模式中，利用沼气池产生沼气可以提高能量的利用效率，不符合题意．
D、生态系统中各种生物的数量和所占的比例是相对稳定的状态．这种平衡是一种动态平衡，之所以会出现这种平衡是因为生态系统具有一定的自我调节能力，在农业生态系统中农药被土壤微生物吸收并分解，这不属于生态系统的自我调节能力，不符合题意．
故选：B
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