自生原理包括自我组织、自我优化、自我调节、自我再生、自我繁殖和自我设计等一系列机制。
自生生态系统具有独特的结构与功能，一方面是源于其中的“生物”，生物能够进行新陈代谢、再生更新等：另一方面是这些生物之间通过各种相互作用进行自组织，实现系统结构与功能的协调，形成有序的整体。
自生原理和协调原理的区分方法
具体看侧重点在哪，以常见的桑基鱼塘为例，该生态系统能成功运转，就说明它符合整体性原理、系统学和工程学原理。
其中的物质可以被多次利用，说明符合物质循环再生原理。其中的生物种类增多，说明符合物种多样性原理；其中各种生物都能正常生活，说明符合协调与平衡原理。
物质循环再生原理。例如，无废弃农业，沼气利用。物种多样性原理。例如，森林生态系统，草原生态系统。协调与平衡原理。例如，三北防护林，沙漠防护林，需适应当地地区情况。整体性原理。例如，人类与自然整体性，动物与自然整体性。