但值得注意的是，2016年2月24日，财政部青海专员办进驻吉姆西进行新能源汽车推广应用核查。吉姆西两次申请撤回申报材料，均是在此之后发生。
此前就有业内人士认为，吉姆西此举是为了规避调查。
而在财政部检查组2016年4月22日向吉姆西发出的《财政检查征求意见函》中，财政部检查组就表示，吉姆西存在财务资料严重造假、销售账目虚假、生产账目虚假、涂改编造生产记录等问题，而且在2015年底“突击上传虚假合格证，意图骗补”。
更值得注意到的事，财政部检查组在上述《意见函》中还认为，吉姆西是随着“检查的深入”才重新提交申报车辆数量。而从时间看，吉姆西2月22日第一次申报，检查组对吉姆西进行核查是2月24日至3月24日，吉姆西第二次申报数量大幅缩减，正是在检查组进驻之后。
另外，吉姆西对于骗补金额认定也有异议。
在起诉书中，吉姆西还表示，财政部仅能针对不实申报的部分做出处理，而对于已经实际销售的车辆则应当秉持实事求是的精神既往不咎。
吉姆西据此认为，财政部应当以其2015年已经实际生产销售的403辆汽车发放补贴，补贴金额约为1.08亿元。
质疑财政部处罚未“一视同仁”
财政部9月8日公布的5家存在骗补行为的企业，均收到了后续处理。
吉姆西在对比各家公司收到的处罚后，认为处理结果标准不一，未做到“一视同仁”。
根据财政部9月8的通报，金龙联合汽车工业（苏州）有限公司、深圳市五洲龙汽车有限公司、河南少林客车股份有限公司、奇瑞万达贵州客车股份有限公司等4家企业，被“追回2015年度2416辆违规上牌车辆获取的中央财政补助预拨资金”、“自2016年起取消上述4家企业中央财政补贴资格”、“对上述4家企业2015年生产销售的其他新能源汽车由当地监管部门逐一严格审核后重新申报，确无问题的车辆可按原政策中央财政继续予以补助”。吉姆西公司收到的处理结果则为“2015年生产的全部车辆中央财政不予补助，追回2015年度预拨的全部中央财政补助资金，同时，由工业和信息化部取消其整车生产资质”。
起诉书中，吉姆西认为，“存在同样行为的五家企业，被告（财政部）却特别针对原告做出了不同的处理决定”。
而据邓学平律师介绍，由于厂房被查封无法继续生产活动，吉姆西已经遣散职工，公司整体已经陷入停顿。此外，苏州吴中区财政分局已开始根据财政部相关处理意见，向吉姆西发出新能源补贴资金催缴函件，要求吉姆西“尽快将已拨付的2015年中央财政预拨补助资金4532万元按原渠道交回，并将整改情况一并上报”。
而根据9月8日财政部公布的《关于地方预决算公开和新能源汽车推广应用补助资金专项检查的通报》，财政部认定吉姆西“恶意骗补情节最严重”。在点名通报中财政部相关司局还称：其他企业骗补，是其车辆缺零部件未生产完成；而吉姆西则是根本不具备相应生产能力。通过编造采购、车辆生产销售等原始凭证和记录，上传虚假合格证，违规办理机动车行驶证等方式，“虚构新能源汽车生产销售业务”。
业内人士：应严厉打击恶意骗补行为
中国电池网董事长于清教则认为，在法治社会，应该严厉打击恶意骗补这种扰乱市场经济的行为。虽然此次对骗补企业的处罚较重，但对新能源行业的持续发展来说是件好事。
于清教还指出，新能源骗补最明显的手段就是虚报数量和有车无电。他还表示，国家、行业政策的制定不能只依靠极小范围的某些专家，应该集思广益，宁可政策出台晚一些，也要尽量周全地考虑政策的可行性和全面性，毕竟试错的成本也是很大的。否则，朝令夕改会令企业和行业无所适从。
