“如果只是把海绵城市当成一批项目去搞的话，那就很简单，反正是按照设计规范投资去建设，但我觉得海绵城市是一个综合的东西。”王政认为，如果把海绵城市建设限制在短时间内，那跟朝着几十年的思路去干的设计方案相比，差异是很大的。
刘世坚手头正在操作两个海绵城市的PPP项目（PPP模式即Public—Private—Partnership的字母缩写，是公共基础设施中的一种项目融资模式。政府与私人组织合作建设城市基础设施项目）。他也感觉到，各城市对待海绵城市的态度并不相同。
他参与的两个项目，执行公司不计成本，愿意花钱、请专家、雇用专业的律师，甚至和地方政府花很长的时间去争吵，希望打造一个扎实的项目，“但不是每个城市都会有这样的想法。”他说。
实际上，在目前各地的操作中，海绵城市已经面临了不少难题。
首先是建设方面，王政认为，像广州老城区的用地就很难解决，“交通本身都成问题，怎么还能大拆大建，再腾出地方建绿地？”他说，海绵城市规划时要涵盖市政和土地开发，比如房地产开发商该怎么执行海绵城市的理念，他们目前也不太清楚，“要尽快配套可操作的审批细则”。
2015年12月10日，四川省遂宁市，工人师傅正在环岛商务中心海绵城市海绵化改造项目“地下蜂窝储水模块系统”施工。
广州市城市规划勘测设计研究院的一位设计师曾考察过国内的海绵城市示范项目，在他看来，尽管建成项目能够满足设计要求，但还没有形成一个成熟的工程验收制度，即没有一套指标来判断海绵城市的效果。
刘世坚表示，他参与的项目从PPP结构设计到技术方面无一不需要创新。比如在绩效考核方面，虽然住建部有框架性指引，但只能作为一个指南，具体到项目上，要根据子项目的不同，制定能够用到实处的规范。
例如怎么从建设角度去考核项目公司是否履行了义务，不仅所有的单体项目都要建好，还有单体项目之间的关联能否实现海绵城市的效果。“建设完以后要验收，然后运营，运营阶段要怎么考核这么多项目放在一起能不能达到预期的效果，这个标准就是要去创新的。”他说。
此外，王政还提出，海绵城市最终要面临城市综合管理的问题。就算海绵城市建好了，周围绿化都挺好，所有的水都可以蓄起来，但是有一些城市污染太重，比如垃圾很快就会将下渗设施堵死，目前已建的人工湿地不及时翻新已经发生不堪负荷的状况，“如果环境改善不了，城市道路不干净，海绵城市很多设施也会很快失去下渗和滞污的效果”。
海绵城市建设需要的资金投入很大。第一批16个试点城市，三年计划总投资865亿元，获得中央的资金补贴只有200亿。这些补贴在多位受访者看来，只是“毛毛雨”。
为了拉动社会资本进入，试点城市评选中鼓励各地创新投融资模式。按照规定，国家对采用PPP模式达到一定比例的城市，将按补助基数奖励10%。
但是，与所有PPP面临的问题相同，海绵城市中很大一部分是偏公益性的项目，使社会资本参与的积极性受到影响。
清华大学建设管理系教授王守清表示，一个项目要应用PPP，关键看是否可明确项目的四个方面：界面、产出要求、绩效指标、收益来源，对于海绵城市项目而言，就是政府付费、污染者付费、受益者付费。如果不能明确这4方面的项目，应用PPP较难或效率不高，还易政企扯皮，甚至不适合PPP。
他认为，海绵城市是个笼统概念，项目笼统上可分为两类：一是蓄水保水的绿地、湿地、流域等；二是雨水、生活污水、工业污水等的治理。对于第一类项目，因四个方面难明确，应用PPP很难；而第二类的四个方面较明确，甚至可定量，容易应用PPP。
王守清认为，不是什么项目都要用PPP，国际上PPP项目仅占所有公共项目的10%-20%，“我们不能像搞运动一样搞PPP，海绵城市很重要，但海绵城市项目不能100%都应用PPP，不能一哄而上都搞PPP。”
